Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CPNE7Q9UBL6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CPNE7Q9UBL6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CPNE7Q9UBL6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CPNE7Q9UBL6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPNE7Q9UBL6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPNE7Q9UBL6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CPNE7Q9UBL6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPNE7Q9UBL6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CPNE7Q9UBL6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPNE7Q9UBL6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CPNE7Q9UBL6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CPNE7Q9UBL6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CPNE7Q9UBL6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CPNE7Q9UBL6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CPNE7Q9UBL6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CPNE7Q9UBL6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CPNE7Q9UBL6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CPNE7Q9UBL6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CPNE7Q9UBL6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CPNE7Q9UBL6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CPNE7Q9UBL6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPNE7Q9UBL6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CPNE7Q9UBL6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CPNE7Q9UBL6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CPNE7Q9UBL6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CPNE7Q9UBL6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CPNE7Q9UBL6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPNE7Q9UBL6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPNE7Q9UBL6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPNE7Q9UBL6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPNE7Q9UBL6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPNE7Q9UBL6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPNE7Q9UBL6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPNE7Q9UBL6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPNE7Q9UBL6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPNE7Q9UBL6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPNE7Q9UBL6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CPNE7Q9UBL6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPNE7Q9UBL6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPNE7Q9UBL6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPNE7Q9UBL6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPNE7Q9UBL6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPNE7Q9UBL6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPNE7Q9UBL6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPNE7Q9UBL6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPNE7Q9UBL6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPNE7Q9UBL6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CPNE7Q9UBL6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPNE7Q9UBL6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPNE7Q9UBL6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPNE7Q9UBL6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CPNE7Q9UBL6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPNE7Q9UBL6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPNE7Q9UBL6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPNE7Q9UBL6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPNE7Q9UBL6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPNE7Q9UBL6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPNE7Q9UBL6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPNE7Q9UBL6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPNE7Q9UBL6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPNE7Q9UBL6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPNE7Q9UBL6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPNE7Q9UBL6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPNE7Q9UBL6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPNE7Q9UBL6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPNE7Q9UBL6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPNE7Q9UBL6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPNE7Q9UBL6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPNE7Q9UBL6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPNE7Q9UBL6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPNE7Q9UBL6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPNE7Q9UBL6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPNE7Q9UBL6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CPNE7Q9UBL6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPNE7Q9UBL6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPNE7Q9UBL6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPNE7Q9UBL6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPNE7Q9UBL6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPNE7Q9UBL6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPNE7Q9UBL6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPNE7Q9UBL6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPNE7Q9UBL6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPNE7Q9UBL6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPNE7Q9UBL6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPNE7Q9UBL6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPNE7Q9UBL6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPNE7Q9UBL6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPNE7Q9UBL6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPNE7Q9UBL6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPNE7Q9UBL6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPNE7Q9UBL6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPNE7Q9UBL6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPNE7Q9UBL6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPNE7Q9UBL6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPNE7Q9UBL6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPNE7Q9UBL6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CPNE7Q9UBL6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPNE7Q9UBL6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPNE7Q9UBL6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms