Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCHIP1Q9P0W5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCHIP1Q9P0W5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCHIP1Q9P0W5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCHIP1Q9P0W5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCHIP1Q9P0W5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCHIP1Q9P0W5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCHIP1Q9P0W5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCHIP1Q9P0W5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCHIP1Q9P0W5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCHIP1Q9P0W5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCHIP1Q9P0W5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCHIP1Q9P0W5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCHIP1Q9P0W5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCHIP1Q9P0W5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCHIP1Q9P0W5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCHIP1Q9P0W5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCHIP1Q9P0W5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCHIP1Q9P0W5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCHIP1Q9P0W5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCHIP1Q9P0W5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCHIP1Q9P0W5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCHIP1Q9P0W5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCHIP1Q9P0W5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCHIP1Q9P0W5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCHIP1Q9P0W5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCHIP1Q9P0W5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCHIP1Q9P0W5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCHIP1Q9P0W5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCHIP1Q9P0W5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCHIP1Q9P0W5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCHIP1Q9P0W5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCHIP1Q9P0W5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCHIP1Q9P0W5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCHIP1Q9P0W5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCHIP1Q9P0W5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCHIP1Q9P0W5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCHIP1Q9P0W5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCHIP1Q9P0W5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCHIP1Q9P0W5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCHIP1Q9P0W5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCHIP1Q9P0W5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCHIP1Q9P0W5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCHIP1Q9P0W5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCHIP1Q9P0W5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCHIP1Q9P0W5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCHIP1Q9P0W5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCHIP1Q9P0W5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCHIP1Q9P0W5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCHIP1Q9P0W5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCHIP1Q9P0W5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCHIP1Q9P0W5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCHIP1Q9P0W5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCHIP1Q9P0W5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCHIP1Q9P0W5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCHIP1Q9P0W5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCHIP1Q9P0W5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms