Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC59Q9P031 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC59Q9P031 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC59Q9P031 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC59Q9P031 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC59Q9P031 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC59Q9P031 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC59Q9P031 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC59Q9P031 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC59Q9P031 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC59Q9P031 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC59Q9P031 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC59Q9P031 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC59Q9P031 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC59Q9P031 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC59Q9P031 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC59Q9P031 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC59Q9P031 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC59Q9P031 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC59Q9P031 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC59Q9P031 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC59Q9P031 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC59Q9P031 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC59Q9P031 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC59Q9P031 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC59Q9P031 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC59Q9P031 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC59Q9P031 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC59Q9P031 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC59Q9P031 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC59Q9P031 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC59Q9P031 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC59Q9P031 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC59Q9P031 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC59Q9P031 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC59Q9P031 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC59Q9P031 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC59Q9P031 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC59Q9P031 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC59Q9P031 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC59Q9P031 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC59Q9P031 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC59Q9P031 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC59Q9P031 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC59Q9P031 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC59Q9P031 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC59Q9P031 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC59Q9P031 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC59Q9P031 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC59Q9P031 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC59Q9P031 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC59Q9P031 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC59Q9P031 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC59Q9P031 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC59Q9P031 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC59Q9P031 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC59Q9P031 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC59Q9P031 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC59Q9P031 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC59Q9P031 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC59Q9P031 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC59Q9P031 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC59Q9P031 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC59Q9P031 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms