Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY87

SPANXC, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXCQ9NY87 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPANXCQ9NY87 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPANXCQ9NY87 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPANXCQ9NY87 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPANXCQ9NY87 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPANXCQ9NY87 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPANXCQ9NY87 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPANXCQ9NY87 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPANXCQ9NY87 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPANXCQ9NY87 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPANXCQ9NY87 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPANXCQ9NY87 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPANXCQ9NY87 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPANXCQ9NY87 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPANXCQ9NY87 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPANXCQ9NY87 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPANXCQ9NY87 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPANXCQ9NY87 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPANXCQ9NY87 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPANXCQ9NY87 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPANXCQ9NY87 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPANXCQ9NY87 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPANXCQ9NY87 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPANXCQ9NY87 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPANXCQ9NY87 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPANXCQ9NY87 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPANXCQ9NY87 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPANXCQ9NY87 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPANXCQ9NY87 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPANXCQ9NY87 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPANXCQ9NY87 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPANXCQ9NY87 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPANXCQ9NY87 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPANXCQ9NY87 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPANXCQ9NY87 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXCQ9NY87 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms