Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIC8BQ9NVN3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIC8BQ9NVN3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIC8BQ9NVN3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIC8BQ9NVN3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIC8BQ9NVN3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIC8BQ9NVN3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RIC8BQ9NVN3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIC8BQ9NVN3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIC8BQ9NVN3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIC8BQ9NVN3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIC8BQ9NVN3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIC8BQ9NVN3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIC8BQ9NVN3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIC8BQ9NVN3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIC8BQ9NVN3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIC8BQ9NVN3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIC8BQ9NVN3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIC8BQ9NVN3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RIC8BQ9NVN3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIC8BQ9NVN3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIC8BQ9NVN3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIC8BQ9NVN3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIC8BQ9NVN3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RIC8BQ9NVN3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIC8BQ9NVN3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIC8BQ9NVN3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIC8BQ9NVN3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIC8BQ9NVN3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIC8BQ9NVN3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIC8BQ9NVN3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIC8BQ9NVN3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIC8BQ9NVN3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIC8BQ9NVN3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIC8BQ9NVN3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIC8BQ9NVN3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIC8BQ9NVN3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIC8BQ9NVN3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIC8BQ9NVN3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIC8BQ9NVN3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIC8BQ9NVN3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIC8BQ9NVN3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIC8BQ9NVN3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIC8BQ9NVN3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIC8BQ9NVN3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIC8BQ9NVN3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIC8BQ9NVN3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIC8BQ9NVN3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIC8BQ9NVN3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIC8BQ9NVN3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIC8BQ9NVN3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIC8BQ9NVN3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIC8BQ9NVN3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIC8BQ9NVN3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIC8BQ9NVN3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIC8BQ9NVN3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms