Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIT2Q9NQR4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NIT2Q9NQR4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIT2Q9NQR4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIT2Q9NQR4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIT2Q9NQR4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIT2Q9NQR4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIT2Q9NQR4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIT2Q9NQR4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIT2Q9NQR4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIT2Q9NQR4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIT2Q9NQR4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIT2Q9NQR4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIT2Q9NQR4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIT2Q9NQR4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIT2Q9NQR4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIT2Q9NQR4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIT2Q9NQR4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIT2Q9NQR4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIT2Q9NQR4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIT2Q9NQR4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIT2Q9NQR4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIT2Q9NQR4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIT2Q9NQR4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIT2Q9NQR4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIT2Q9NQR4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NIT2Q9NQR4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIT2Q9NQR4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIT2Q9NQR4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIT2Q9NQR4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIT2Q9NQR4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIT2Q9NQR4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIT2Q9NQR4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIT2Q9NQR4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIT2Q9NQR4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIT2Q9NQR4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIT2Q9NQR4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIT2Q9NQR4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIT2Q9NQR4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIT2Q9NQR4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIT2Q9NQR4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIT2Q9NQR4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIT2Q9NQR4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIT2Q9NQR4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIT2Q9NQR4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIT2Q9NQR4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIT2Q9NQR4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIT2Q9NQR4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIT2Q9NQR4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIT2Q9NQR4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIT2Q9NQR4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIT2Q9NQR4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIT2Q9NQR4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIT2Q9NQR4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NIT2Q9NQR4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIT2Q9NQR4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NIT2Q9NQR4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NIT2Q9NQR4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIT2Q9NQR4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIT2Q9NQR4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIT2Q9NQR4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIT2Q9NQR4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIT2Q9NQR4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIT2Q9NQR4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIT2Q9NQR4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIT2Q9NQR4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIT2Q9NQR4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIT2Q9NQR4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIT2Q9NQR4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIT2Q9NQR4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NIT2Q9NQR4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NIT2Q9NQR4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIT2Q9NQR4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIT2Q9NQR4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIT2Q9NQR4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIT2Q9NQR4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms