Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PREBQ9HCU5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PREBQ9HCU5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PREBQ9HCU5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PREBQ9HCU5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PREBQ9HCU5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PREBQ9HCU5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PREBQ9HCU5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PREBQ9HCU5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PREBQ9HCU5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PREBQ9HCU5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PREBQ9HCU5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PREBQ9HCU5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PREBQ9HCU5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PREBQ9HCU5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PREBQ9HCU5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PREBQ9HCU5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PREBQ9HCU5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PREBQ9HCU5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PREBQ9HCU5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PREBQ9HCU5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PREBQ9HCU5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PREBQ9HCU5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PREBQ9HCU5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PREBQ9HCU5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PREBQ9HCU5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PREBQ9HCU5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREBQ9HCU5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PREBQ9HCU5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PREBQ9HCU5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PREBQ9HCU5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PREBQ9HCU5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREBQ9HCU5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PREBQ9HCU5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PREBQ9HCU5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PREBQ9HCU5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREBQ9HCU5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREBQ9HCU5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREBQ9HCU5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PREBQ9HCU5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREBQ9HCU5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREBQ9HCU5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREBQ9HCU5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREBQ9HCU5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PREBQ9HCU5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PREBQ9HCU5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PREBQ9HCU5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PREBQ9HCU5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PREBQ9HCU5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PREBQ9HCU5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PREBQ9HCU5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PREBQ9HCU5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PREBQ9HCU5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PREBQ9HCU5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PREBQ9HCU5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PREBQ9HCU5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PREBQ9HCU5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREBQ9HCU5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREBQ9HCU5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREBQ9HCU5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREBQ9HCU5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PREBQ9HCU5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PREBQ9HCU5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PREBQ9HCU5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PREBQ9HCU5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PREBQ9HCU5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PREBQ9HCU5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PREBQ9HCU5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PREBQ9HCU5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PREBQ9HCU5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PREBQ9HCU5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PREBQ9HCU5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PREBQ9HCU5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PREBQ9HCU5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms