Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPS7BQ9H9Q2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPS7BQ9H9Q2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPS7BQ9H9Q2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPS7BQ9H9Q2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPS7BQ9H9Q2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPS7BQ9H9Q2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COPS7BQ9H9Q2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPS7BQ9H9Q2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPS7BQ9H9Q2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPS7BQ9H9Q2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPS7BQ9H9Q2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPS7BQ9H9Q2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPS7BQ9H9Q2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPS7BQ9H9Q2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPS7BQ9H9Q2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPS7BQ9H9Q2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPS7BQ9H9Q2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPS7BQ9H9Q2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPS7BQ9H9Q2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPS7BQ9H9Q2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPS7BQ9H9Q2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPS7BQ9H9Q2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPS7BQ9H9Q2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPS7BQ9H9Q2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPS7BQ9H9Q2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPS7BQ9H9Q2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPS7BQ9H9Q2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPS7BQ9H9Q2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPS7BQ9H9Q2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
COPS7BQ9H9Q2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPS7BQ9H9Q2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPS7BQ9H9Q2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPS7BQ9H9Q2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPS7BQ9H9Q2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPS7BQ9H9Q2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPS7BQ9H9Q2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPS7BQ9H9Q2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPS7BQ9H9Q2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPS7BQ9H9Q2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPS7BQ9H9Q2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPS7BQ9H9Q2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPS7BQ9H9Q2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPS7BQ9H9Q2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPS7BQ9H9Q2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPS7BQ9H9Q2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPS7BQ9H9Q2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPS7BQ9H9Q2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COPS7BQ9H9Q2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPS7BQ9H9Q2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPS7BQ9H9Q2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPS7BQ9H9Q2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPS7BQ9H9Q2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPS7BQ9H9Q2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPS7BQ9H9Q2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPS7BQ9H9Q2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPS7BQ9H9Q2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPS7BQ9H9Q2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPS7BQ9H9Q2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COPS7BQ9H9Q2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPS7BQ9H9Q2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPS7BQ9H9Q2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms