Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX17Q9H6I2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX17Q9H6I2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX17Q9H6I2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX17Q9H6I2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX17Q9H6I2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX17Q9H6I2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX17Q9H6I2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX17Q9H6I2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX17Q9H6I2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX17Q9H6I2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX17Q9H6I2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX17Q9H6I2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX17Q9H6I2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX17Q9H6I2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX17Q9H6I2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX17Q9H6I2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX17Q9H6I2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX17Q9H6I2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX17Q9H6I2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX17Q9H6I2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX17Q9H6I2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX17Q9H6I2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX17Q9H6I2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX17Q9H6I2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX17Q9H6I2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX17Q9H6I2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX17Q9H6I2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX17Q9H6I2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX17Q9H6I2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX17Q9H6I2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX17Q9H6I2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX17Q9H6I2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX17Q9H6I2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX17Q9H6I2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX17Q9H6I2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX17Q9H6I2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX17Q9H6I2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX17Q9H6I2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX17Q9H6I2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX17Q9H6I2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX17Q9H6I2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX17Q9H6I2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX17Q9H6I2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX17Q9H6I2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX17Q9H6I2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SOX17Q9H6I2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX17Q9H6I2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX17Q9H6I2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX17Q9H6I2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX17Q9H6I2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX17Q9H6I2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX17Q9H6I2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX17Q9H6I2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX17Q9H6I2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX17Q9H6I2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX17Q9H6I2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX17Q9H6I2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX17Q9H6I2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX17Q9H6I2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX17Q9H6I2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX17Q9H6I2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms