Protein–RNA interactions for Protein: Q9H503

BANF2, Barrier-to-autointegration factor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF2Q9H503 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BANF2Q9H503 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BANF2Q9H503 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BANF2Q9H503 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BANF2Q9H503 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BANF2Q9H503 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BANF2Q9H503 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BANF2Q9H503 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BANF2Q9H503 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BANF2Q9H503 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BANF2Q9H503 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BANF2Q9H503 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BANF2Q9H503 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BANF2Q9H503 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BANF2Q9H503 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BANF2Q9H503 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BANF2Q9H503 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BANF2Q9H503 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BANF2Q9H503 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BANF2Q9H503 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BANF2Q9H503 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BANF2Q9H503 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BANF2Q9H503 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BANF2Q9H503 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BANF2Q9H503 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF2Q9H503 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF2Q9H503 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF2Q9H503 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF2Q9H503 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF2Q9H503 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BANF2Q9H503 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BANF2Q9H503 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BANF2Q9H503 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BANF2Q9H503 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BANF2Q9H503 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BANF2Q9H503 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF2Q9H503 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF2Q9H503 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF2Q9H503 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BANF2Q9H503 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BANF2Q9H503 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BANF2Q9H503 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BANF2Q9H503 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BANF2Q9H503 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BANF2Q9H503 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BANF2Q9H503 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BANF2Q9H503 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BANF2Q9H503 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BANF2Q9H503 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF2Q9H503 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF2Q9H503 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF2Q9H503 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF2Q9H503 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BANF2Q9H503 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BANF2Q9H503 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF2Q9H503 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BANF2Q9H503 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BANF2Q9H503 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF2Q9H503 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF2Q9H503 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF2Q9H503 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms