Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED28Q9H204 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED28Q9H204 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED28Q9H204 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED28Q9H204 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED28Q9H204 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED28Q9H204 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED28Q9H204 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED28Q9H204 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED28Q9H204 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED28Q9H204 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED28Q9H204 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED28Q9H204 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED28Q9H204 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED28Q9H204 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED28Q9H204 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED28Q9H204 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED28Q9H204 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED28Q9H204 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED28Q9H204 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED28Q9H204 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED28Q9H204 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED28Q9H204 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED28Q9H204 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED28Q9H204 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED28Q9H204 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED28Q9H204 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED28Q9H204 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED28Q9H204 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MED28Q9H204 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED28Q9H204 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED28Q9H204 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED28Q9H204 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED28Q9H204 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED28Q9H204 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED28Q9H204 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED28Q9H204 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED28Q9H204 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED28Q9H204 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED28Q9H204 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED28Q9H204 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED28Q9H204 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED28Q9H204 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED28Q9H204 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED28Q9H204 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED28Q9H204 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED28Q9H204 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED28Q9H204 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED28Q9H204 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED28Q9H204 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED28Q9H204 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED28Q9H204 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED28Q9H204 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED28Q9H204 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED28Q9H204 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED28Q9H204 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED28Q9H204 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED28Q9H204 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED28Q9H204 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED28Q9H204 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED28Q9H204 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED28Q9H204 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED28Q9H204 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED28Q9H204 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED28Q9H204 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED28Q9H204 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED28Q9H204 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED28Q9H204 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED28Q9H204 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED28Q9H204 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED28Q9H204 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED28Q9H204 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED28Q9H204 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED28Q9H204 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED28Q9H204 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms