Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REPIN1Q9BWE0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REPIN1Q9BWE0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REPIN1Q9BWE0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
REPIN1Q9BWE0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REPIN1Q9BWE0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REPIN1Q9BWE0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
REPIN1Q9BWE0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REPIN1Q9BWE0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REPIN1Q9BWE0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
REPIN1Q9BWE0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REPIN1Q9BWE0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REPIN1Q9BWE0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REPIN1Q9BWE0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REPIN1Q9BWE0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REPIN1Q9BWE0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REPIN1Q9BWE0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REPIN1Q9BWE0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REPIN1Q9BWE0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REPIN1Q9BWE0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REPIN1Q9BWE0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REPIN1Q9BWE0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
REPIN1Q9BWE0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
REPIN1Q9BWE0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
REPIN1Q9BWE0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REPIN1Q9BWE0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
REPIN1Q9BWE0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
REPIN1Q9BWE0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REPIN1Q9BWE0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REPIN1Q9BWE0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REPIN1Q9BWE0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
REPIN1Q9BWE0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
REPIN1Q9BWE0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
REPIN1Q9BWE0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
REPIN1Q9BWE0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
REPIN1Q9BWE0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REPIN1Q9BWE0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REPIN1Q9BWE0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REPIN1Q9BWE0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REPIN1Q9BWE0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REPIN1Q9BWE0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REPIN1Q9BWE0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REPIN1Q9BWE0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REPIN1Q9BWE0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REPIN1Q9BWE0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
REPIN1Q9BWE0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
REPIN1Q9BWE0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
REPIN1Q9BWE0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REPIN1Q9BWE0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REPIN1Q9BWE0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
REPIN1Q9BWE0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REPIN1Q9BWE0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
REPIN1Q9BWE0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REPIN1Q9BWE0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
REPIN1Q9BWE0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REPIN1Q9BWE0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
REPIN1Q9BWE0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
REPIN1Q9BWE0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REPIN1Q9BWE0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REPIN1Q9BWE0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REPIN1Q9BWE0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REPIN1Q9BWE0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REPIN1Q9BWE0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REPIN1Q9BWE0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REPIN1Q9BWE0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REPIN1Q9BWE0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REPIN1Q9BWE0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REPIN1Q9BWE0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REPIN1Q9BWE0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms