Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUP58Q9BVL2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUP58Q9BVL2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUP58Q9BVL2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUP58Q9BVL2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUP58Q9BVL2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUP58Q9BVL2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUP58Q9BVL2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NUP58Q9BVL2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NUP58Q9BVL2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUP58Q9BVL2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUP58Q9BVL2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUP58Q9BVL2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP58Q9BVL2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP58Q9BVL2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP58Q9BVL2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP58Q9BVL2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP58Q9BVL2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP58Q9BVL2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP58Q9BVL2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP58Q9BVL2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP58Q9BVL2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP58Q9BVL2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP58Q9BVL2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP58Q9BVL2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP58Q9BVL2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP58Q9BVL2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP58Q9BVL2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP58Q9BVL2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP58Q9BVL2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP58Q9BVL2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP58Q9BVL2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP58Q9BVL2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP58Q9BVL2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP58Q9BVL2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP58Q9BVL2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP58Q9BVL2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP58Q9BVL2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP58Q9BVL2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP58Q9BVL2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP58Q9BVL2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP58Q9BVL2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP58Q9BVL2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP58Q9BVL2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP58Q9BVL2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP58Q9BVL2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP58Q9BVL2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP58Q9BVL2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP58Q9BVL2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP58Q9BVL2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP58Q9BVL2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP58Q9BVL2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP58Q9BVL2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP58Q9BVL2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP58Q9BVL2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP58Q9BVL2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP58Q9BVL2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP58Q9BVL2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP58Q9BVL2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP58Q9BVL2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP58Q9BVL2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP58Q9BVL2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP58Q9BVL2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP58Q9BVL2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP58Q9BVL2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP58Q9BVL2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP58Q9BVL2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP58Q9BVL2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP58Q9BVL2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUP58Q9BVL2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP58Q9BVL2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP58Q9BVL2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP58Q9BVL2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP58Q9BVL2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP58Q9BVL2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP58Q9BVL2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP58Q9BVL2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP58Q9BVL2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms