Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MKNK1Q9BUB5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKNK1Q9BUB5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKNK1Q9BUB5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MKNK1Q9BUB5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MKNK1Q9BUB5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MKNK1Q9BUB5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MKNK1Q9BUB5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MKNK1Q9BUB5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MKNK1Q9BUB5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MKNK1Q9BUB5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MKNK1Q9BUB5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MKNK1Q9BUB5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKNK1Q9BUB5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKNK1Q9BUB5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKNK1Q9BUB5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MKNK1Q9BUB5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MKNK1Q9BUB5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MKNK1Q9BUB5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MKNK1Q9BUB5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MKNK1Q9BUB5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MKNK1Q9BUB5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MKNK1Q9BUB5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MKNK1Q9BUB5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MKNK1Q9BUB5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKNK1Q9BUB5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
MKNK1Q9BUB5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MKNK1Q9BUB5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MKNK1Q9BUB5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MKNK1Q9BUB5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MKNK1Q9BUB5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MKNK1Q9BUB5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKNK1Q9BUB5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MKNK1Q9BUB5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MKNK1Q9BUB5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKNK1Q9BUB5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKNK1Q9BUB5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKNK1Q9BUB5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MKNK1Q9BUB5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MKNK1Q9BUB5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MKNK1Q9BUB5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKNK1Q9BUB5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MKNK1Q9BUB5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MKNK1Q9BUB5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MKNK1Q9BUB5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MKNK1Q9BUB5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MKNK1Q9BUB5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MKNK1Q9BUB5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MKNK1Q9BUB5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MKNK1Q9BUB5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MKNK1Q9BUB5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MKNK1Q9BUB5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MKNK1Q9BUB5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MKNK1Q9BUB5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MKNK1Q9BUB5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MKNK1Q9BUB5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MKNK1Q9BUB5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MKNK1Q9BUB5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MKNK1Q9BUB5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MKNK1Q9BUB5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MKNK1Q9BUB5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MKNK1Q9BUB5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MKNK1Q9BUB5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MKNK1Q9BUB5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MKNK1Q9BUB5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MKNK1Q9BUB5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MKNK1Q9BUB5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MKNK1Q9BUB5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MKNK1Q9BUB5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MKNK1Q9BUB5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MKNK1Q9BUB5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MKNK1Q9BUB5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MKNK1Q9BUB5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MKNK1Q9BUB5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MKNK1Q9BUB5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MKNK1Q9BUB5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MKNK1Q9BUB5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MKNK1Q9BUB5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
MKNK1Q9BUB5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MKNK1Q9BUB5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKNK1Q9BUB5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MKNK1Q9BUB5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKNK1Q9BUB5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKNK1Q9BUB5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKNK1Q9BUB5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MKNK1Q9BUB5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms