Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDFIP1Q9BT67 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDFIP1Q9BT67 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDFIP1Q9BT67 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDFIP1Q9BT67 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDFIP1Q9BT67 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDFIP1Q9BT67 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDFIP1Q9BT67 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDFIP1Q9BT67 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDFIP1Q9BT67 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NDFIP1Q9BT67 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDFIP1Q9BT67 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDFIP1Q9BT67 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDFIP1Q9BT67 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDFIP1Q9BT67 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDFIP1Q9BT67 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDFIP1Q9BT67 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDFIP1Q9BT67 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDFIP1Q9BT67 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDFIP1Q9BT67 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDFIP1Q9BT67 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDFIP1Q9BT67 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDFIP1Q9BT67 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDFIP1Q9BT67 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDFIP1Q9BT67 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDFIP1Q9BT67 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDFIP1Q9BT67 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDFIP1Q9BT67 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDFIP1Q9BT67 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDFIP1Q9BT67 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDFIP1Q9BT67 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDFIP1Q9BT67 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDFIP1Q9BT67 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDFIP1Q9BT67 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDFIP1Q9BT67 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDFIP1Q9BT67 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDFIP1Q9BT67 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDFIP1Q9BT67 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDFIP1Q9BT67 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDFIP1Q9BT67 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDFIP1Q9BT67 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDFIP1Q9BT67 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDFIP1Q9BT67 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDFIP1Q9BT67 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NDFIP1Q9BT67 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms