Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF4Q9BSR8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF4Q9BSR8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF4Q9BSR8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF4Q9BSR8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF4Q9BSR8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF4Q9BSR8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
YIPF4Q9BSR8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YIPF4Q9BSR8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YIPF4Q9BSR8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YIPF4Q9BSR8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YIPF4Q9BSR8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YIPF4Q9BSR8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YIPF4Q9BSR8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YIPF4Q9BSR8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YIPF4Q9BSR8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YIPF4Q9BSR8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YIPF4Q9BSR8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YIPF4Q9BSR8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
YIPF4Q9BSR8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF4Q9BSR8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF4Q9BSR8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF4Q9BSR8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF4Q9BSR8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF4Q9BSR8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YIPF4Q9BSR8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
YIPF4Q9BSR8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF4Q9BSR8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF4Q9BSR8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YIPF4Q9BSR8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YIPF4Q9BSR8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YIPF4Q9BSR8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YIPF4Q9BSR8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YIPF4Q9BSR8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YIPF4Q9BSR8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF4Q9BSR8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF4Q9BSR8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YIPF4Q9BSR8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YIPF4Q9BSR8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YIPF4Q9BSR8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YIPF4Q9BSR8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YIPF4Q9BSR8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YIPF4Q9BSR8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF4Q9BSR8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF4Q9BSR8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YIPF4Q9BSR8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF4Q9BSR8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YIPF4Q9BSR8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF4Q9BSR8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF4Q9BSR8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF4Q9BSR8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF4Q9BSR8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF4Q9BSR8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF4Q9BSR8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF4Q9BSR8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF4Q9BSR8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF4Q9BSR8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms