Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC39A3Q9BRY0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC39A3Q9BRY0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC39A3Q9BRY0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC39A3Q9BRY0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC39A3Q9BRY0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC39A3Q9BRY0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC39A3Q9BRY0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC39A3Q9BRY0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC39A3Q9BRY0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC39A3Q9BRY0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC39A3Q9BRY0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC39A3Q9BRY0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC39A3Q9BRY0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC39A3Q9BRY0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC39A3Q9BRY0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC39A3Q9BRY0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC39A3Q9BRY0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC39A3Q9BRY0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC39A3Q9BRY0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC39A3Q9BRY0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC39A3Q9BRY0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC39A3Q9BRY0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC39A3Q9BRY0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC39A3Q9BRY0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC39A3Q9BRY0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC39A3Q9BRY0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC39A3Q9BRY0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC39A3Q9BRY0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC39A3Q9BRY0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC39A3Q9BRY0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC39A3Q9BRY0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC39A3Q9BRY0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC39A3Q9BRY0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC39A3Q9BRY0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC39A3Q9BRY0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC39A3Q9BRY0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC39A3Q9BRY0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC39A3Q9BRY0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC39A3Q9BRY0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC39A3Q9BRY0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC39A3Q9BRY0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC39A3Q9BRY0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC39A3Q9BRY0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC39A3Q9BRY0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC39A3Q9BRY0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC39A3Q9BRY0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC39A3Q9BRY0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC39A3Q9BRY0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC39A3Q9BRY0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC39A3Q9BRY0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC39A3Q9BRY0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC39A3Q9BRY0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC39A3Q9BRY0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC39A3Q9BRY0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC39A3Q9BRY0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC39A3Q9BRY0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC39A3Q9BRY0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC39A3Q9BRY0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC39A3Q9BRY0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A3Q9BRY0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A3Q9BRY0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A3Q9BRY0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A3Q9BRY0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC39A3Q9BRY0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC39A3Q9BRY0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC39A3Q9BRY0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC39A3Q9BRY0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC39A3Q9BRY0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC39A3Q9BRY0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A3Q9BRY0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A3Q9BRY0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A3Q9BRY0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A3Q9BRY0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC39A3Q9BRY0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC39A3Q9BRY0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC39A3Q9BRY0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC39A3Q9BRY0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC39A3Q9BRY0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A3Q9BRY0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A3Q9BRY0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A3Q9BRY0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A3Q9BRY0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A3Q9BRY0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A3Q9BRY0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC39A3Q9BRY0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms