Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CITED4Q96RK1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CITED4Q96RK1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CITED4Q96RK1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CITED4Q96RK1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CITED4Q96RK1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CITED4Q96RK1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITED4Q96RK1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITED4Q96RK1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CITED4Q96RK1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITED4Q96RK1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITED4Q96RK1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITED4Q96RK1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CITED4Q96RK1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CITED4Q96RK1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CITED4Q96RK1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITED4Q96RK1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CITED4Q96RK1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITED4Q96RK1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITED4Q96RK1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITED4Q96RK1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITED4Q96RK1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITED4Q96RK1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CITED4Q96RK1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CITED4Q96RK1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CITED4Q96RK1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITED4Q96RK1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CITED4Q96RK1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITED4Q96RK1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITED4Q96RK1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CITED4Q96RK1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CITED4Q96RK1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CITED4Q96RK1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CITED4Q96RK1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CITED4Q96RK1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CITED4Q96RK1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CITED4Q96RK1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CITED4Q96RK1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CITED4Q96RK1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CITED4Q96RK1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CITED4Q96RK1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CITED4Q96RK1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CITED4Q96RK1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CITED4Q96RK1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CITED4Q96RK1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CITED4Q96RK1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CITED4Q96RK1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CITED4Q96RK1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CITED4Q96RK1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CITED4Q96RK1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CITED4Q96RK1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CITED4Q96RK1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CITED4Q96RK1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CITED4Q96RK1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CITED4Q96RK1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CITED4Q96RK1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CITED4Q96RK1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CITED4Q96RK1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CITED4Q96RK1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CITED4Q96RK1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CITED4Q96RK1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CITED4Q96RK1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CITED4Q96RK1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CITED4Q96RK1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms