Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CCDC7Q96M83 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CCDC7Q96M83 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CCDC7Q96M83 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC7Q96M83 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC7Q96M83 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC7Q96M83 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC7Q96M83 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC7Q96M83 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC7Q96M83 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
CCDC7Q96M83 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC7Q96M83 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CCDC7Q96M83 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC7Q96M83 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC7Q96M83 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC7Q96M83 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC7Q96M83 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC7Q96M83 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC7Q96M83 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC7Q96M83 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC7Q96M83 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC7Q96M83 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC7Q96M83 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC7Q96M83 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CCDC7Q96M83 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC7Q96M83 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC7Q96M83 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC7Q96M83 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC7Q96M83 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CCDC7Q96M83 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC7Q96M83 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC7Q96M83 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC7Q96M83 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC7Q96M83 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC7Q96M83 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC7Q96M83 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC7Q96M83 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC7Q96M83 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC7Q96M83 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC7Q96M83 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.7■■■■□ 3.78
CCDC7Q96M83 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.78
CCDC7Q96M83 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC7Q96M83 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC7Q96M83 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC7Q96M83 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC7Q96M83 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC7Q96M83 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC7Q96M83 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC7Q96M83 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC7Q96M83 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC7Q96M83 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC7Q96M83 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC7Q96M83 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC7Q96M83 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CCDC7Q96M83 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC7Q96M83 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC7Q96M83 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC7Q96M83 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC7Q96M83 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC7Q96M83 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC7Q96M83 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CCDC7Q96M83 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
CCDC7Q96M83 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC7Q96M83 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC7Q96M83 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC7Q96M83 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC7Q96M83 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC7Q96M83 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC7Q96M83 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC7Q96M83 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC7Q96M83 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC7Q96M83 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC7Q96M83 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC7Q96M83 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC7Q96M83 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC7Q96M83 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC7Q96M83 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC7Q96M83 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC7Q96M83 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC7Q96M83 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC7Q96M83 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC7Q96M83 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC7Q96M83 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC7Q96M83 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC7Q96M83 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC7Q96M83 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms