Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SERAC1Q96JX3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SERAC1Q96JX3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SERAC1Q96JX3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SERAC1Q96JX3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SERAC1Q96JX3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SERAC1Q96JX3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SERAC1Q96JX3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SERAC1Q96JX3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SERAC1Q96JX3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SERAC1Q96JX3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SERAC1Q96JX3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SERAC1Q96JX3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SERAC1Q96JX3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SERAC1Q96JX3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SERAC1Q96JX3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SERAC1Q96JX3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SERAC1Q96JX3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SERAC1Q96JX3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SERAC1Q96JX3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SERAC1Q96JX3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SERAC1Q96JX3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SERAC1Q96JX3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SERAC1Q96JX3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SERAC1Q96JX3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SERAC1Q96JX3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SERAC1Q96JX3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SERAC1Q96JX3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SERAC1Q96JX3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SERAC1Q96JX3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SERAC1Q96JX3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SERAC1Q96JX3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SERAC1Q96JX3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SERAC1Q96JX3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SERAC1Q96JX3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SERAC1Q96JX3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SERAC1Q96JX3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SERAC1Q96JX3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SERAC1Q96JX3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SERAC1Q96JX3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SERAC1Q96JX3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SERAC1Q96JX3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SERAC1Q96JX3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SERAC1Q96JX3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SERAC1Q96JX3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SERAC1Q96JX3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SERAC1Q96JX3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SERAC1Q96JX3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SERAC1Q96JX3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SERAC1Q96JX3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SERAC1Q96JX3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SERAC1Q96JX3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SERAC1Q96JX3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SERAC1Q96JX3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SERAC1Q96JX3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SERAC1Q96JX3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SERAC1Q96JX3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SERAC1Q96JX3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SERAC1Q96JX3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SERAC1Q96JX3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SERAC1Q96JX3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SERAC1Q96JX3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SERAC1Q96JX3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SERAC1Q96JX3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SERAC1Q96JX3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SERAC1Q96JX3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SERAC1Q96JX3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SERAC1Q96JX3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SERAC1Q96JX3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SERAC1Q96JX3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SERAC1Q96JX3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SERAC1Q96JX3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SERAC1Q96JX3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms