Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPD52L3Q96J77 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPD52L3Q96J77 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPD52L3Q96J77 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPD52L3Q96J77 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPD52L3Q96J77 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPD52L3Q96J77 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPD52L3Q96J77 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPD52L3Q96J77 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPD52L3Q96J77 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPD52L3Q96J77 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPD52L3Q96J77 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPD52L3Q96J77 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPD52L3Q96J77 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPD52L3Q96J77 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPD52L3Q96J77 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPD52L3Q96J77 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPD52L3Q96J77 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPD52L3Q96J77 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPD52L3Q96J77 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPD52L3Q96J77 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPD52L3Q96J77 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPD52L3Q96J77 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPD52L3Q96J77 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPD52L3Q96J77 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPD52L3Q96J77 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPD52L3Q96J77 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPD52L3Q96J77 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPD52L3Q96J77 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPD52L3Q96J77 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPD52L3Q96J77 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPD52L3Q96J77 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPD52L3Q96J77 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TPD52L3Q96J77 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPD52L3Q96J77 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPD52L3Q96J77 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPD52L3Q96J77 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPD52L3Q96J77 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPD52L3Q96J77 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPD52L3Q96J77 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPD52L3Q96J77 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPD52L3Q96J77 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPD52L3Q96J77 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPD52L3Q96J77 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPD52L3Q96J77 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPD52L3Q96J77 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPD52L3Q96J77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPD52L3Q96J77 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPD52L3Q96J77 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPD52L3Q96J77 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPD52L3Q96J77 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPD52L3Q96J77 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPD52L3Q96J77 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TPD52L3Q96J77 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TPD52L3Q96J77 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPD52L3Q96J77 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPD52L3Q96J77 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPD52L3Q96J77 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPD52L3Q96J77 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPD52L3Q96J77 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms