Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCMH1Q96GD3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCMH1Q96GD3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCMH1Q96GD3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCMH1Q96GD3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCMH1Q96GD3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCMH1Q96GD3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCMH1Q96GD3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCMH1Q96GD3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCMH1Q96GD3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCMH1Q96GD3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCMH1Q96GD3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCMH1Q96GD3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCMH1Q96GD3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCMH1Q96GD3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCMH1Q96GD3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCMH1Q96GD3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCMH1Q96GD3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCMH1Q96GD3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCMH1Q96GD3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCMH1Q96GD3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCMH1Q96GD3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCMH1Q96GD3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCMH1Q96GD3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCMH1Q96GD3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCMH1Q96GD3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCMH1Q96GD3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCMH1Q96GD3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCMH1Q96GD3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCMH1Q96GD3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCMH1Q96GD3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCMH1Q96GD3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCMH1Q96GD3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCMH1Q96GD3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCMH1Q96GD3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCMH1Q96GD3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCMH1Q96GD3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCMH1Q96GD3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCMH1Q96GD3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCMH1Q96GD3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCMH1Q96GD3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCMH1Q96GD3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCMH1Q96GD3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCMH1Q96GD3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCMH1Q96GD3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCMH1Q96GD3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCMH1Q96GD3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCMH1Q96GD3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCMH1Q96GD3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCMH1Q96GD3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCMH1Q96GD3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCMH1Q96GD3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCMH1Q96GD3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCMH1Q96GD3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCMH1Q96GD3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCMH1Q96GD3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCMH1Q96GD3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCMH1Q96GD3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCMH1Q96GD3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCMH1Q96GD3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCMH1Q96GD3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCMH1Q96GD3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCMH1Q96GD3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCMH1Q96GD3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCMH1Q96GD3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCMH1Q96GD3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCMH1Q96GD3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCMH1Q96GD3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCMH1Q96GD3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCMH1Q96GD3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCMH1Q96GD3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCMH1Q96GD3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCMH1Q96GD3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCMH1Q96GD3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCMH1Q96GD3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCMH1Q96GD3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCMH1Q96GD3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCMH1Q96GD3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCMH1Q96GD3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCMH1Q96GD3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCMH1Q96GD3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCMH1Q96GD3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCMH1Q96GD3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCMH1Q96GD3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCMH1Q96GD3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCMH1Q96GD3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms