Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPDL1Q96EA4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPDL1Q96EA4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPDL1Q96EA4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPDL1Q96EA4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPDL1Q96EA4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPDL1Q96EA4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPDL1Q96EA4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPDL1Q96EA4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPDL1Q96EA4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPDL1Q96EA4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPDL1Q96EA4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPDL1Q96EA4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPDL1Q96EA4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPDL1Q96EA4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SPDL1Q96EA4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPDL1Q96EA4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPDL1Q96EA4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPDL1Q96EA4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPDL1Q96EA4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPDL1Q96EA4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPDL1Q96EA4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPDL1Q96EA4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPDL1Q96EA4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPDL1Q96EA4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDL1Q96EA4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDL1Q96EA4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDL1Q96EA4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPDL1Q96EA4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPDL1Q96EA4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDL1Q96EA4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDL1Q96EA4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDL1Q96EA4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDL1Q96EA4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDL1Q96EA4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDL1Q96EA4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPDL1Q96EA4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPDL1Q96EA4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPDL1Q96EA4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPDL1Q96EA4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPDL1Q96EA4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPDL1Q96EA4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPDL1Q96EA4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPDL1Q96EA4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPDL1Q96EA4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPDL1Q96EA4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SPDL1Q96EA4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPDL1Q96EA4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SPDL1Q96EA4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPDL1Q96EA4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPDL1Q96EA4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPDL1Q96EA4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPDL1Q96EA4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPDL1Q96EA4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms