Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRIM44Q96DX7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRIM44Q96DX7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRIM44Q96DX7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRIM44Q96DX7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRIM44Q96DX7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRIM44Q96DX7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRIM44Q96DX7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRIM44Q96DX7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRIM44Q96DX7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRIM44Q96DX7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRIM44Q96DX7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRIM44Q96DX7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM44Q96DX7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM44Q96DX7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRIM44Q96DX7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRIM44Q96DX7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM44Q96DX7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM44Q96DX7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM44Q96DX7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRIM44Q96DX7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRIM44Q96DX7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRIM44Q96DX7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRIM44Q96DX7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRIM44Q96DX7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRIM44Q96DX7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRIM44Q96DX7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRIM44Q96DX7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRIM44Q96DX7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRIM44Q96DX7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM44Q96DX7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM44Q96DX7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM44Q96DX7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM44Q96DX7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRIM44Q96DX7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRIM44Q96DX7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRIM44Q96DX7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRIM44Q96DX7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRIM44Q96DX7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRIM44Q96DX7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRIM44Q96DX7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRIM44Q96DX7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRIM44Q96DX7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRIM44Q96DX7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRIM44Q96DX7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRIM44Q96DX7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRIM44Q96DX7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRIM44Q96DX7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TRIM44Q96DX7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRIM44Q96DX7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRIM44Q96DX7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRIM44Q96DX7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRIM44Q96DX7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRIM44Q96DX7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRIM44Q96DX7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRIM44Q96DX7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRIM44Q96DX7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRIM44Q96DX7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM44Q96DX7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM44Q96DX7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM44Q96DX7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRIM44Q96DX7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRIM44Q96DX7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRIM44Q96DX7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRIM44Q96DX7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRIM44Q96DX7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM44Q96DX7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM44Q96DX7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRIM44Q96DX7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRIM44Q96DX7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRIM44Q96DX7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRIM44Q96DX7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRIM44Q96DX7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRIM44Q96DX7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRIM44Q96DX7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRIM44Q96DX7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRIM44Q96DX7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRIM44Q96DX7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRIM44Q96DX7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRIM44Q96DX7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM44Q96DX7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM44Q96DX7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM44Q96DX7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM44Q96DX7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM44Q96DX7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM44Q96DX7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM44Q96DX7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM44Q96DX7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM44Q96DX7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRIM44Q96DX7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRIM44Q96DX7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRIM44Q96DX7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRIM44Q96DX7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRIM44Q96DX7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRIM44Q96DX7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRIM44Q96DX7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRIM44Q96DX7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRIM44Q96DX7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRIM44Q96DX7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRIM44Q96DX7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms