Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB39BQ96DA2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB39BQ96DA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB39BQ96DA2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB39BQ96DA2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB39BQ96DA2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB39BQ96DA2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB39BQ96DA2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB39BQ96DA2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB39BQ96DA2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB39BQ96DA2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB39BQ96DA2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB39BQ96DA2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB39BQ96DA2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB39BQ96DA2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB39BQ96DA2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB39BQ96DA2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB39BQ96DA2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB39BQ96DA2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB39BQ96DA2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB39BQ96DA2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB39BQ96DA2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB39BQ96DA2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms