Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARVELD3Q96A59 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MARVELD3Q96A59 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARVELD3Q96A59 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARVELD3Q96A59 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARVELD3Q96A59 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MARVELD3Q96A59 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARVELD3Q96A59 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARVELD3Q96A59 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MARVELD3Q96A59 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARVELD3Q96A59 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARVELD3Q96A59 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARVELD3Q96A59 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARVELD3Q96A59 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARVELD3Q96A59 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARVELD3Q96A59 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARVELD3Q96A59 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARVELD3Q96A59 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARVELD3Q96A59 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARVELD3Q96A59 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARVELD3Q96A59 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARVELD3Q96A59 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARVELD3Q96A59 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARVELD3Q96A59 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARVELD3Q96A59 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARVELD3Q96A59 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARVELD3Q96A59 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARVELD3Q96A59 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MARVELD3Q96A59 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARVELD3Q96A59 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARVELD3Q96A59 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARVELD3Q96A59 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARVELD3Q96A59 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARVELD3Q96A59 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARVELD3Q96A59 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARVELD3Q96A59 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARVELD3Q96A59 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARVELD3Q96A59 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARVELD3Q96A59 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARVELD3Q96A59 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARVELD3Q96A59 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARVELD3Q96A59 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARVELD3Q96A59 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARVELD3Q96A59 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MARVELD3Q96A59 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARVELD3Q96A59 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARVELD3Q96A59 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARVELD3Q96A59 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARVELD3Q96A59 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARVELD3Q96A59 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARVELD3Q96A59 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MARVELD3Q96A59 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MARVELD3Q96A59 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MARVELD3Q96A59 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARVELD3Q96A59 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARVELD3Q96A59 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARVELD3Q96A59 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARVELD3Q96A59 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARVELD3Q96A59 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARVELD3Q96A59 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARVELD3Q96A59 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms