Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
ABCA10Q8WWZ4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
ABCA10Q8WWZ4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.59■■■■■ 5.21
ABCA10Q8WWZ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
ABCA10Q8WWZ4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC47.56■■■■■ 5.2
ABCA10Q8WWZ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
ABCA10Q8WWZ4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
ABCA10Q8WWZ4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
ABCA10Q8WWZ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.48■■■■■ 5.19
ABCA10Q8WWZ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC47.48■■■■■ 5.19
ABCA10Q8WWZ4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC47.45■■■■■ 5.19
ABCA10Q8WWZ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
ABCA10Q8WWZ4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
ABCA10Q8WWZ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
ABCA10Q8WWZ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
ABCA10Q8WWZ4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC47.34■■■■■ 5.17
ABCA10Q8WWZ4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
ABCA10Q8WWZ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
ABCA10Q8WWZ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
ABCA10Q8WWZ4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC47.23■■■■■ 5.15
ABCA10Q8WWZ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
ABCA10Q8WWZ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC47.21■■■■■ 5.15
ABCA10Q8WWZ4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
ABCA10Q8WWZ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
ABCA10Q8WWZ4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
ABCA10Q8WWZ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC47.18■■■■■ 5.14
ABCA10Q8WWZ4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
ABCA10Q8WWZ4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
ABCA10Q8WWZ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
ABCA10Q8WWZ4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
ABCA10Q8WWZ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCA10Q8WWZ4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCA10Q8WWZ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCA10Q8WWZ4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
ABCA10Q8WWZ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC47.05■■■■■ 5.12
ABCA10Q8WWZ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
ABCA10Q8WWZ4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.04■■■■■ 5.12
ABCA10Q8WWZ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCA10Q8WWZ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCA10Q8WWZ4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
ABCA10Q8WWZ4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
ABCA10Q8WWZ4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ABCA10Q8WWZ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ABCA10Q8WWZ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
ABCA10Q8WWZ4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
ABCA10Q8WWZ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC46.92■■■■■ 5.1
ABCA10Q8WWZ4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC46.89■■■■■ 5.1
ABCA10Q8WWZ4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
ABCA10Q8WWZ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC46.84■■■■■ 5.09
ABCA10Q8WWZ4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
ABCA10Q8WWZ4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
ABCA10Q8WWZ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
ABCA10Q8WWZ4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC46.79■■■■■ 5.08
ABCA10Q8WWZ4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.75■■■■■ 5.07
ABCA10Q8WWZ4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC46.74■■■■■ 5.07
ABCA10Q8WWZ4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
ABCA10Q8WWZ4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC46.72■■■■■ 5.07
ABCA10Q8WWZ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
ABCA10Q8WWZ4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
ABCA10Q8WWZ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.7■■■■■ 5.07
ABCA10Q8WWZ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.7■■■■■ 5.07
ABCA10Q8WWZ4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC46.69■■■■■ 5.06
ABCA10Q8WWZ4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
ABCA10Q8WWZ4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
ABCA10Q8WWZ4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
ABCA10Q8WWZ4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
ABCA10Q8WWZ4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
ABCA10Q8WWZ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC46.65■■■■■ 5.06
ABCA10Q8WWZ4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
ABCA10Q8WWZ4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
ABCA10Q8WWZ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
ABCA10Q8WWZ4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
ABCA10Q8WWZ4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
ABCA10Q8WWZ4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
ABCA10Q8WWZ4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
ABCA10Q8WWZ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
ABCA10Q8WWZ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
ABCA10Q8WWZ4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
ABCA10Q8WWZ4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
ABCA10Q8WWZ4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
ABCA10Q8WWZ4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
ABCA10Q8WWZ4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCA10Q8WWZ4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCA10Q8WWZ4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
ABCA10Q8WWZ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC46.47■■■■■ 5.03
ABCA10Q8WWZ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC46.47■■■■■ 5.03
ABCA10Q8WWZ4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
ABCA10Q8WWZ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.02
ABCA10Q8WWZ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
ABCA10Q8WWZ4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
ABCA10Q8WWZ4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
ABCA10Q8WWZ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
ABCA10Q8WWZ4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
ABCA10Q8WWZ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
ABCA10Q8WWZ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC46.37■■■■■ 5.01
ABCA10Q8WWZ4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
ABCA10Q8WWZ4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
ABCA10Q8WWZ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC46.34■■■■■ 5.01
ABCA10Q8WWZ4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC46.34■■■■■ 5.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms