Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC107Q8WV48 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC107Q8WV48 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC107Q8WV48 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC107Q8WV48 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC107Q8WV48 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC107Q8WV48 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC107Q8WV48 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC107Q8WV48 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC107Q8WV48 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC107Q8WV48 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC107Q8WV48 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC107Q8WV48 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC107Q8WV48 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC107Q8WV48 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC107Q8WV48 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC107Q8WV48 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC107Q8WV48 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC107Q8WV48 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC107Q8WV48 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC107Q8WV48 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC107Q8WV48 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC107Q8WV48 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC107Q8WV48 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC107Q8WV48 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC107Q8WV48 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC107Q8WV48 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC107Q8WV48 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC107Q8WV48 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC107Q8WV48 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC107Q8WV48 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC107Q8WV48 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC107Q8WV48 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC107Q8WV48 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC107Q8WV48 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC107Q8WV48 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC107Q8WV48 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC107Q8WV48 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC107Q8WV48 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC107Q8WV48 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC107Q8WV48 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC107Q8WV48 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC107Q8WV48 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC107Q8WV48 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC107Q8WV48 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC107Q8WV48 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC107Q8WV48 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms