Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VN1R17PQ8TDU5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VN1R17PQ8TDU5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VN1R17PQ8TDU5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R17PQ8TDU5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R17PQ8TDU5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R17PQ8TDU5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R17PQ8TDU5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R17PQ8TDU5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R17PQ8TDU5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R17PQ8TDU5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R17PQ8TDU5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VN1R17PQ8TDU5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R17PQ8TDU5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R17PQ8TDU5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R17PQ8TDU5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R17PQ8TDU5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R17PQ8TDU5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R17PQ8TDU5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R17PQ8TDU5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R17PQ8TDU5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R17PQ8TDU5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VN1R17PQ8TDU5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms