Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA94

ZNF563, Zinc finger protein 563, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF563Q8TA94 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF563Q8TA94 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF563Q8TA94 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF563Q8TA94 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF563Q8TA94 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF563Q8TA94 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF563Q8TA94 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF563Q8TA94 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF563Q8TA94 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF563Q8TA94 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF563Q8TA94 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF563Q8TA94 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF563Q8TA94 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF563Q8TA94 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF563Q8TA94 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF563Q8TA94 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF563Q8TA94 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF563Q8TA94 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF563Q8TA94 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF563Q8TA94 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF563Q8TA94 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF563Q8TA94 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF563Q8TA94 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF563Q8TA94 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF563Q8TA94 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF563Q8TA94 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF563Q8TA94 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF563Q8TA94 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF563Q8TA94 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF563Q8TA94 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF563Q8TA94 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF563Q8TA94 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF563Q8TA94 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF563Q8TA94 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF563Q8TA94 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF563Q8TA94 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF563Q8TA94 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF563Q8TA94 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF563Q8TA94 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF563Q8TA94 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF563Q8TA94 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF563Q8TA94 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF563Q8TA94 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF563Q8TA94 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF563Q8TA94 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF563Q8TA94 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF563Q8TA94 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF563Q8TA94 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF563Q8TA94 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF563Q8TA94 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF563Q8TA94 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF563Q8TA94 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF563Q8TA94 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF563Q8TA94 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF563Q8TA94 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF563Q8TA94 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF563Q8TA94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF563Q8TA94 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF563Q8TA94 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF563Q8TA94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF563Q8TA94 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF563Q8TA94 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF563Q8TA94 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF563Q8TA94 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF563Q8TA94 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF563Q8TA94 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF563Q8TA94 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF563Q8TA94 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF563Q8TA94 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF563Q8TA94 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms