Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK2A3Q8NEV1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK2A3Q8NEV1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK2A3Q8NEV1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK2A3Q8NEV1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK2A3Q8NEV1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK2A3Q8NEV1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK2A3Q8NEV1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CSNK2A3Q8NEV1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK2A3Q8NEV1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK2A3Q8NEV1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK2A3Q8NEV1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSNK2A3Q8NEV1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK2A3Q8NEV1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK2A3Q8NEV1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK2A3Q8NEV1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK2A3Q8NEV1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK2A3Q8NEV1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK2A3Q8NEV1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK2A3Q8NEV1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK2A3Q8NEV1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK2A3Q8NEV1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK2A3Q8NEV1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSNK2A3Q8NEV1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK2A3Q8NEV1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK2A3Q8NEV1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK2A3Q8NEV1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK2A3Q8NEV1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK2A3Q8NEV1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK2A3Q8NEV1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK2A3Q8NEV1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK2A3Q8NEV1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK2A3Q8NEV1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A3Q8NEV1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A3Q8NEV1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK2A3Q8NEV1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2A3Q8NEV1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2A3Q8NEV1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2A3Q8NEV1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2A3Q8NEV1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms