Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC33Q8N5R6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC33Q8N5R6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC33Q8N5R6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC33Q8N5R6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC33Q8N5R6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC33Q8N5R6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC33Q8N5R6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC33Q8N5R6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC33Q8N5R6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC33Q8N5R6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC33Q8N5R6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC33Q8N5R6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC33Q8N5R6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC33Q8N5R6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC33Q8N5R6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC33Q8N5R6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC33Q8N5R6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC33Q8N5R6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC33Q8N5R6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC33Q8N5R6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC33Q8N5R6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC33Q8N5R6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC33Q8N5R6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC33Q8N5R6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC33Q8N5R6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC33Q8N5R6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC33Q8N5R6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC33Q8N5R6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC33Q8N5R6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC33Q8N5R6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC33Q8N5R6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC33Q8N5R6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC33Q8N5R6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC33Q8N5R6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC33Q8N5R6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC33Q8N5R6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC33Q8N5R6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC33Q8N5R6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC33Q8N5R6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC33Q8N5R6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC33Q8N5R6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC33Q8N5R6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC33Q8N5R6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC33Q8N5R6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC33Q8N5R6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC33Q8N5R6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC33Q8N5R6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC33Q8N5R6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC33Q8N5R6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC33Q8N5R6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC33Q8N5R6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC33Q8N5R6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC33Q8N5R6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC33Q8N5R6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC33Q8N5R6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC33Q8N5R6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC33Q8N5R6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC33Q8N5R6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC33Q8N5R6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC33Q8N5R6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC33Q8N5R6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC33Q8N5R6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC33Q8N5R6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC33Q8N5R6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC33Q8N5R6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC33Q8N5R6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC33Q8N5R6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC33Q8N5R6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC33Q8N5R6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC33Q8N5R6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC33Q8N5R6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC33Q8N5R6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC33Q8N5R6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC33Q8N5R6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC33Q8N5R6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC33Q8N5R6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC33Q8N5R6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC33Q8N5R6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC33Q8N5R6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC33Q8N5R6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC33Q8N5R6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC33Q8N5R6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC33Q8N5R6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC33Q8N5R6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC33Q8N5R6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC33Q8N5R6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC33Q8N5R6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms