Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZCCHC9Q8N567 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ZCCHC9Q8N567 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZCCHC9Q8N567 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZCCHC9Q8N567 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZCCHC9Q8N567 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZCCHC9Q8N567 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZCCHC9Q8N567 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZCCHC9Q8N567 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZCCHC9Q8N567 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZCCHC9Q8N567 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZCCHC9Q8N567 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZCCHC9Q8N567 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZCCHC9Q8N567 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZCCHC9Q8N567 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZCCHC9Q8N567 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZCCHC9Q8N567 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZCCHC9Q8N567 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZCCHC9Q8N567 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZCCHC9Q8N567 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZCCHC9Q8N567 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZCCHC9Q8N567 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZCCHC9Q8N567 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZCCHC9Q8N567 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZCCHC9Q8N567 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZCCHC9Q8N567 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZCCHC9Q8N567 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZCCHC9Q8N567 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZCCHC9Q8N567 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZCCHC9Q8N567 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZCCHC9Q8N567 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZCCHC9Q8N567 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZCCHC9Q8N567 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZCCHC9Q8N567 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZCCHC9Q8N567 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZCCHC9Q8N567 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZCCHC9Q8N567 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZCCHC9Q8N567 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZCCHC9Q8N567 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZCCHC9Q8N567 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZCCHC9Q8N567 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZCCHC9Q8N567 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZCCHC9Q8N567 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZCCHC9Q8N567 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZCCHC9Q8N567 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZCCHC9Q8N567 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZCCHC9Q8N567 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZCCHC9Q8N567 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZCCHC9Q8N567 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZCCHC9Q8N567 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZCCHC9Q8N567 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZCCHC9Q8N567 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZCCHC9Q8N567 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZCCHC9Q8N567 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZCCHC9Q8N567 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZCCHC9Q8N567 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZCCHC9Q8N567 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZCCHC9Q8N567 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZCCHC9Q8N567 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZCCHC9Q8N567 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZCCHC9Q8N567 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZCCHC9Q8N567 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZCCHC9Q8N567 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZCCHC9Q8N567 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZCCHC9Q8N567 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZCCHC9Q8N567 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZCCHC9Q8N567 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZCCHC9Q8N567 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZCCHC9Q8N567 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZCCHC9Q8N567 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZCCHC9Q8N567 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZCCHC9Q8N567 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZCCHC9Q8N567 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZCCHC9Q8N567 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZCCHC9Q8N567 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZCCHC9Q8N567 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZCCHC9Q8N567 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZCCHC9Q8N567 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZCCHC9Q8N567 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZCCHC9Q8N567 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZCCHC9Q8N567 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZCCHC9Q8N567 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZCCHC9Q8N567 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZCCHC9Q8N567 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZCCHC9Q8N567 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZCCHC9Q8N567 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms