Protein–RNA interactions for Protein: Q8N490

PNKD, Probable hydrolase PNKD, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKDQ8N490 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKDQ8N490 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKDQ8N490 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNKDQ8N490 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNKDQ8N490 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNKDQ8N490 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNKDQ8N490 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNKDQ8N490 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNKDQ8N490 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNKDQ8N490 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNKDQ8N490 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNKDQ8N490 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNKDQ8N490 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNKDQ8N490 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNKDQ8N490 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNKDQ8N490 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNKDQ8N490 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNKDQ8N490 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNKDQ8N490 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNKDQ8N490 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNKDQ8N490 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNKDQ8N490 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNKDQ8N490 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNKDQ8N490 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNKDQ8N490 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PNKDQ8N490 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNKDQ8N490 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNKDQ8N490 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNKDQ8N490 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNKDQ8N490 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNKDQ8N490 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNKDQ8N490 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNKDQ8N490 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNKDQ8N490 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNKDQ8N490 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNKDQ8N490 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNKDQ8N490 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNKDQ8N490 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNKDQ8N490 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNKDQ8N490 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms