Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PELI3Q8N2H9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PELI3Q8N2H9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PELI3Q8N2H9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PELI3Q8N2H9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PELI3Q8N2H9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PELI3Q8N2H9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PELI3Q8N2H9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PELI3Q8N2H9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PELI3Q8N2H9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PELI3Q8N2H9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PELI3Q8N2H9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PELI3Q8N2H9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PELI3Q8N2H9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PELI3Q8N2H9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PELI3Q8N2H9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PELI3Q8N2H9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PELI3Q8N2H9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PELI3Q8N2H9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PELI3Q8N2H9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PELI3Q8N2H9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PELI3Q8N2H9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PELI3Q8N2H9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PELI3Q8N2H9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PELI3Q8N2H9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PELI3Q8N2H9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PELI3Q8N2H9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PELI3Q8N2H9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PELI3Q8N2H9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PELI3Q8N2H9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PELI3Q8N2H9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PELI3Q8N2H9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PELI3Q8N2H9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PELI3Q8N2H9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PELI3Q8N2H9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PELI3Q8N2H9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PELI3Q8N2H9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PELI3Q8N2H9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PELI3Q8N2H9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PELI3Q8N2H9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PELI3Q8N2H9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PELI3Q8N2H9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PELI3Q8N2H9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PELI3Q8N2H9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PELI3Q8N2H9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PELI3Q8N2H9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PELI3Q8N2H9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PELI3Q8N2H9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PELI3Q8N2H9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PELI3Q8N2H9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PELI3Q8N2H9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PELI3Q8N2H9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PELI3Q8N2H9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PELI3Q8N2H9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PELI3Q8N2H9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PELI3Q8N2H9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PELI3Q8N2H9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PELI3Q8N2H9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PELI3Q8N2H9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PELI3Q8N2H9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PELI3Q8N2H9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PELI3Q8N2H9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PELI3Q8N2H9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PELI3Q8N2H9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PELI3Q8N2H9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PELI3Q8N2H9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms