Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLGN4XQ8N0W4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLGN4XQ8N0W4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLGN4XQ8N0W4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLGN4XQ8N0W4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLGN4XQ8N0W4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLGN4XQ8N0W4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLGN4XQ8N0W4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLGN4XQ8N0W4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLGN4XQ8N0W4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLGN4XQ8N0W4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLGN4XQ8N0W4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLGN4XQ8N0W4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLGN4XQ8N0W4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLGN4XQ8N0W4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLGN4XQ8N0W4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLGN4XQ8N0W4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLGN4XQ8N0W4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLGN4XQ8N0W4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLGN4XQ8N0W4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLGN4XQ8N0W4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLGN4XQ8N0W4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLGN4XQ8N0W4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NLGN4XQ8N0W4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLGN4XQ8N0W4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLGN4XQ8N0W4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLGN4XQ8N0W4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLGN4XQ8N0W4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLGN4XQ8N0W4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLGN4XQ8N0W4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLGN4XQ8N0W4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NLGN4XQ8N0W4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLGN4XQ8N0W4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLGN4XQ8N0W4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLGN4XQ8N0W4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLGN4XQ8N0W4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLGN4XQ8N0W4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLGN4XQ8N0W4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLGN4XQ8N0W4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLGN4XQ8N0W4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLGN4XQ8N0W4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NLGN4XQ8N0W4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLGN4XQ8N0W4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NLGN4XQ8N0W4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLGN4XQ8N0W4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLGN4XQ8N0W4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLGN4XQ8N0W4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLGN4XQ8N0W4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NLGN4XQ8N0W4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLGN4XQ8N0W4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLGN4XQ8N0W4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NLGN4XQ8N0W4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLGN4XQ8N0W4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NLGN4XQ8N0W4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLGN4XQ8N0W4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLGN4XQ8N0W4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLGN4XQ8N0W4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLGN4XQ8N0W4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLGN4XQ8N0W4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLGN4XQ8N0W4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLGN4XQ8N0W4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLGN4XQ8N0W4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLGN4XQ8N0W4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLGN4XQ8N0W4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLGN4XQ8N0W4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLGN4XQ8N0W4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLGN4XQ8N0W4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLGN4XQ8N0W4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLGN4XQ8N0W4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLGN4XQ8N0W4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLGN4XQ8N0W4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms