Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APRG1Q8IVJ8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APRG1Q8IVJ8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APRG1Q8IVJ8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APRG1Q8IVJ8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APRG1Q8IVJ8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APRG1Q8IVJ8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APRG1Q8IVJ8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APRG1Q8IVJ8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APRG1Q8IVJ8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APRG1Q8IVJ8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APRG1Q8IVJ8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APRG1Q8IVJ8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APRG1Q8IVJ8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APRG1Q8IVJ8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APRG1Q8IVJ8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APRG1Q8IVJ8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APRG1Q8IVJ8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APRG1Q8IVJ8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APRG1Q8IVJ8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APRG1Q8IVJ8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APRG1Q8IVJ8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APRG1Q8IVJ8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
APRG1Q8IVJ8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APRG1Q8IVJ8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APRG1Q8IVJ8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APRG1Q8IVJ8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APRG1Q8IVJ8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APRG1Q8IVJ8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APRG1Q8IVJ8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
APRG1Q8IVJ8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APRG1Q8IVJ8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APRG1Q8IVJ8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APRG1Q8IVJ8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms