Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUE6

HIST2H2AB, Histone H2A type 2-B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ABQ8IUE6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIST2H2ABQ8IUE6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIST2H2ABQ8IUE6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIST2H2ABQ8IUE6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIST2H2ABQ8IUE6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST2H2ABQ8IUE6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST2H2ABQ8IUE6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST2H2ABQ8IUE6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIST2H2ABQ8IUE6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIST2H2ABQ8IUE6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIST2H2ABQ8IUE6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIST2H2ABQ8IUE6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST2H2ABQ8IUE6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIST2H2ABQ8IUE6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIST2H2ABQ8IUE6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIST2H2ABQ8IUE6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIST2H2ABQ8IUE6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2ABQ8IUE6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2ABQ8IUE6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2ABQ8IUE6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2ABQ8IUE6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2ABQ8IUE6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIST2H2ABQ8IUE6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIST2H2ABQ8IUE6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIST2H2ABQ8IUE6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIST2H2ABQ8IUE6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIST2H2ABQ8IUE6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2ABQ8IUE6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2ABQ8IUE6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2ABQ8IUE6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIST2H2ABQ8IUE6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2ABQ8IUE6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2ABQ8IUE6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIST2H2ABQ8IUE6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIST2H2ABQ8IUE6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIST2H2ABQ8IUE6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIST2H2ABQ8IUE6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIST2H2ABQ8IUE6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIST2H2ABQ8IUE6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2ABQ8IUE6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2ABQ8IUE6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2ABQ8IUE6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIST2H2ABQ8IUE6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIST2H2ABQ8IUE6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIST2H2ABQ8IUE6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2ABQ8IUE6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIST2H2ABQ8IUE6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST2H2ABQ8IUE6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIST2H2ABQ8IUE6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIST2H2ABQ8IUE6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIST2H2ABQ8IUE6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIST2H2ABQ8IUE6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIST2H2ABQ8IUE6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST2H2ABQ8IUE6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIST2H2ABQ8IUE6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIST2H2ABQ8IUE6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIST2H2ABQ8IUE6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIST2H2ABQ8IUE6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST2H2ABQ8IUE6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIST2H2ABQ8IUE6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIST2H2ABQ8IUE6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST2H2ABQ8IUE6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms