Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPRSS6Q8IU80 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMPRSS6Q8IU80 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMPRSS6Q8IU80 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMPRSS6Q8IU80 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMPRSS6Q8IU80 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMPRSS6Q8IU80 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPRSS6Q8IU80 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TMPRSS6Q8IU80 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMPRSS6Q8IU80 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMPRSS6Q8IU80 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMPRSS6Q8IU80 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMPRSS6Q8IU80 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMPRSS6Q8IU80 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMPRSS6Q8IU80 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMPRSS6Q8IU80 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPRSS6Q8IU80 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMPRSS6Q8IU80 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPRSS6Q8IU80 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPRSS6Q8IU80 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPRSS6Q8IU80 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPRSS6Q8IU80 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPRSS6Q8IU80 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMPRSS6Q8IU80 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPRSS6Q8IU80 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMPRSS6Q8IU80 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPRSS6Q8IU80 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPRSS6Q8IU80 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPRSS6Q8IU80 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMPRSS6Q8IU80 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPRSS6Q8IU80 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPRSS6Q8IU80 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPRSS6Q8IU80 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMPRSS6Q8IU80 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPRSS6Q8IU80 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMPRSS6Q8IU80 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMPRSS6Q8IU80 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMPRSS6Q8IU80 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMPRSS6Q8IU80 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMPRSS6Q8IU80 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMPRSS6Q8IU80 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMPRSS6Q8IU80 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMPRSS6Q8IU80 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMPRSS6Q8IU80 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMPRSS6Q8IU80 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMPRSS6Q8IU80 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPRSS6Q8IU80 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPRSS6Q8IU80 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPRSS6Q8IU80 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPRSS6Q8IU80 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMPRSS6Q8IU80 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMPRSS6Q8IU80 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMPRSS6Q8IU80 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPRSS6Q8IU80 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPRSS6Q8IU80 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPRSS6Q8IU80 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPRSS6Q8IU80 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPRSS6Q8IU80 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPRSS6Q8IU80 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPRSS6Q8IU80 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPRSS6Q8IU80 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPRSS6Q8IU80 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms