Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7H5

TMED4, Transmembrane emp24 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED4Q7Z7H5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMED4Q7Z7H5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMED4Q7Z7H5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMED4Q7Z7H5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED4Q7Z7H5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED4Q7Z7H5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED4Q7Z7H5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED4Q7Z7H5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED4Q7Z7H5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED4Q7Z7H5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED4Q7Z7H5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED4Q7Z7H5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED4Q7Z7H5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED4Q7Z7H5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED4Q7Z7H5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMED4Q7Z7H5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED4Q7Z7H5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED4Q7Z7H5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED4Q7Z7H5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED4Q7Z7H5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED4Q7Z7H5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED4Q7Z7H5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED4Q7Z7H5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED4Q7Z7H5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED4Q7Z7H5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED4Q7Z7H5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED4Q7Z7H5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED4Q7Z7H5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMED4Q7Z7H5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED4Q7Z7H5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED4Q7Z7H5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED4Q7Z7H5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED4Q7Z7H5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED4Q7Z7H5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED4Q7Z7H5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED4Q7Z7H5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED4Q7Z7H5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED4Q7Z7H5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED4Q7Z7H5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED4Q7Z7H5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED4Q7Z7H5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED4Q7Z7H5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED4Q7Z7H5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMED4Q7Z7H5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms