Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATG9AQ7Z3C6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
ATG9AQ7Z3C6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ATG9AQ7Z3C6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATG9AQ7Z3C6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATG9AQ7Z3C6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
ATG9AQ7Z3C6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATG9AQ7Z3C6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATG9AQ7Z3C6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATG9AQ7Z3C6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATG9AQ7Z3C6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATG9AQ7Z3C6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATG9AQ7Z3C6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATG9AQ7Z3C6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATG9AQ7Z3C6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATG9AQ7Z3C6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATG9AQ7Z3C6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATG9AQ7Z3C6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATG9AQ7Z3C6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATG9AQ7Z3C6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATG9AQ7Z3C6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATG9AQ7Z3C6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATG9AQ7Z3C6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
ATG9AQ7Z3C6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATG9AQ7Z3C6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATG9AQ7Z3C6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATG9AQ7Z3C6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATG9AQ7Z3C6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATG9AQ7Z3C6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATG9AQ7Z3C6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATG9AQ7Z3C6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ATG9AQ7Z3C6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ATG9AQ7Z3C6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATG9AQ7Z3C6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATG9AQ7Z3C6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATG9AQ7Z3C6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATG9AQ7Z3C6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATG9AQ7Z3C6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATG9AQ7Z3C6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATG9AQ7Z3C6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATG9AQ7Z3C6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATG9AQ7Z3C6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATG9AQ7Z3C6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATG9AQ7Z3C6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATG9AQ7Z3C6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATG9AQ7Z3C6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATG9AQ7Z3C6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATG9AQ7Z3C6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATG9AQ7Z3C6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATG9AQ7Z3C6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ATG9AQ7Z3C6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATG9AQ7Z3C6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATG9AQ7Z3C6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATG9AQ7Z3C6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATG9AQ7Z3C6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ATG9AQ7Z3C6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATG9AQ7Z3C6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATG9AQ7Z3C6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
ATG9AQ7Z3C6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATG9AQ7Z3C6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATG9AQ7Z3C6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATG9AQ7Z3C6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATG9AQ7Z3C6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATG9AQ7Z3C6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATG9AQ7Z3C6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATG9AQ7Z3C6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ATG9AQ7Z3C6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ATG9AQ7Z3C6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATG9AQ7Z3C6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATG9AQ7Z3C6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATG9AQ7Z3C6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATG9AQ7Z3C6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATG9AQ7Z3C6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATG9AQ7Z3C6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATG9AQ7Z3C6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATG9AQ7Z3C6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATG9AQ7Z3C6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATG9AQ7Z3C6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATG9AQ7Z3C6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATG9AQ7Z3C6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATG9AQ7Z3C6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ATG9AQ7Z3C6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ATG9AQ7Z3C6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATG9AQ7Z3C6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ATG9AQ7Z3C6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ATG9AQ7Z3C6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ATG9AQ7Z3C6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATG9AQ7Z3C6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATG9AQ7Z3C6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATG9AQ7Z3C6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ATG9AQ7Z3C6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATG9AQ7Z3C6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATG9AQ7Z3C6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATG9AQ7Z3C6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATG9AQ7Z3C6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATG9AQ7Z3C6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATG9AQ7Z3C6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ATG9AQ7Z3C6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms