Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN03

LINC00322, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00322, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00322Q6ZN03 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00322Q6ZN03 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00322Q6ZN03 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00322Q6ZN03 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00322Q6ZN03 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00322Q6ZN03 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00322Q6ZN03 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00322Q6ZN03 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00322Q6ZN03 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00322Q6ZN03 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00322Q6ZN03 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00322Q6ZN03 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00322Q6ZN03 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00322Q6ZN03 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00322Q6ZN03 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00322Q6ZN03 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00322Q6ZN03 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00322Q6ZN03 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00322Q6ZN03 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00322Q6ZN03 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00322Q6ZN03 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00322Q6ZN03 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00322Q6ZN03 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00322Q6ZN03 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00322Q6ZN03 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00322Q6ZN03 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00322Q6ZN03 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00322Q6ZN03 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00322Q6ZN03 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00322Q6ZN03 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00322Q6ZN03 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00322Q6ZN03 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00322Q6ZN03 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00322Q6ZN03 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00322Q6ZN03 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00322Q6ZN03 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00322Q6ZN03 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00322Q6ZN03 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00322Q6ZN03 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00322Q6ZN03 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00322Q6ZN03 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms