Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCBE1Q6UXH8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCBE1Q6UXH8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCBE1Q6UXH8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCBE1Q6UXH8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCBE1Q6UXH8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCBE1Q6UXH8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCBE1Q6UXH8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCBE1Q6UXH8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCBE1Q6UXH8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCBE1Q6UXH8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCBE1Q6UXH8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCBE1Q6UXH8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCBE1Q6UXH8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCBE1Q6UXH8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCBE1Q6UXH8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCBE1Q6UXH8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCBE1Q6UXH8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCBE1Q6UXH8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCBE1Q6UXH8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCBE1Q6UXH8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCBE1Q6UXH8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCBE1Q6UXH8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCBE1Q6UXH8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCBE1Q6UXH8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCBE1Q6UXH8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCBE1Q6UXH8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCBE1Q6UXH8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCBE1Q6UXH8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCBE1Q6UXH8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCBE1Q6UXH8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCBE1Q6UXH8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCBE1Q6UXH8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCBE1Q6UXH8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCBE1Q6UXH8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCBE1Q6UXH8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCBE1Q6UXH8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCBE1Q6UXH8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCBE1Q6UXH8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCBE1Q6UXH8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCBE1Q6UXH8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCBE1Q6UXH8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCBE1Q6UXH8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCBE1Q6UXH8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCBE1Q6UXH8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCBE1Q6UXH8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCBE1Q6UXH8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCBE1Q6UXH8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCBE1Q6UXH8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCBE1Q6UXH8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCBE1Q6UXH8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCBE1Q6UXH8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCBE1Q6UXH8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCBE1Q6UXH8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCBE1Q6UXH8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCBE1Q6UXH8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms