Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI78

TMEM65, Transmembrane protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM65Q6PI78 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM65Q6PI78 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM65Q6PI78 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM65Q6PI78 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM65Q6PI78 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM65Q6PI78 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM65Q6PI78 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM65Q6PI78 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM65Q6PI78 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM65Q6PI78 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM65Q6PI78 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM65Q6PI78 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM65Q6PI78 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM65Q6PI78 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM65Q6PI78 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM65Q6PI78 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM65Q6PI78 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM65Q6PI78 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM65Q6PI78 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM65Q6PI78 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM65Q6PI78 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM65Q6PI78 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM65Q6PI78 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM65Q6PI78 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM65Q6PI78 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM65Q6PI78 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM65Q6PI78 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM65Q6PI78 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM65Q6PI78 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM65Q6PI78 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM65Q6PI78 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM65Q6PI78 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM65Q6PI78 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM65Q6PI78 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM65Q6PI78 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM65Q6PI78 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM65Q6PI78 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM65Q6PI78 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM65Q6PI78 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM65Q6PI78 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM65Q6PI78 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM65Q6PI78 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM65Q6PI78 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM65Q6PI78 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms