Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFRF1Q6IPR1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFRF1Q6IPR1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFRF1Q6IPR1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFRF1Q6IPR1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFRF1Q6IPR1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFRF1Q6IPR1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFRF1Q6IPR1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFRF1Q6IPR1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFRF1Q6IPR1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFRF1Q6IPR1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFRF1Q6IPR1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFRF1Q6IPR1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETFRF1Q6IPR1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETFRF1Q6IPR1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETFRF1Q6IPR1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETFRF1Q6IPR1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETFRF1Q6IPR1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETFRF1Q6IPR1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETFRF1Q6IPR1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFRF1Q6IPR1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETFRF1Q6IPR1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFRF1Q6IPR1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFRF1Q6IPR1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFRF1Q6IPR1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFRF1Q6IPR1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFRF1Q6IPR1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFRF1Q6IPR1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFRF1Q6IPR1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFRF1Q6IPR1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ETFRF1Q6IPR1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETFRF1Q6IPR1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETFRF1Q6IPR1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETFRF1Q6IPR1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETFRF1Q6IPR1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETFRF1Q6IPR1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETFRF1Q6IPR1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETFRF1Q6IPR1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETFRF1Q6IPR1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETFRF1Q6IPR1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETFRF1Q6IPR1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ETFRF1Q6IPR1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ETFRF1Q6IPR1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ETFRF1Q6IPR1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ETFRF1Q6IPR1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ETFRF1Q6IPR1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ETFRF1Q6IPR1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETFRF1Q6IPR1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ETFRF1Q6IPR1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ETFRF1Q6IPR1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETFRF1Q6IPR1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETFRF1Q6IPR1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETFRF1Q6IPR1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETFRF1Q6IPR1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms