Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUMO4Q6EEV6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SUMO4Q6EEV6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SUMO4Q6EEV6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SUMO4Q6EEV6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SUMO4Q6EEV6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUMO4Q6EEV6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUMO4Q6EEV6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUMO4Q6EEV6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUMO4Q6EEV6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUMO4Q6EEV6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUMO4Q6EEV6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUMO4Q6EEV6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUMO4Q6EEV6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUMO4Q6EEV6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUMO4Q6EEV6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUMO4Q6EEV6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUMO4Q6EEV6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUMO4Q6EEV6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUMO4Q6EEV6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUMO4Q6EEV6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUMO4Q6EEV6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SUMO4Q6EEV6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SUMO4Q6EEV6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SUMO4Q6EEV6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SUMO4Q6EEV6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SUMO4Q6EEV6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SUMO4Q6EEV6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUMO4Q6EEV6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUMO4Q6EEV6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SUMO4Q6EEV6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SUMO4Q6EEV6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SUMO4Q6EEV6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SUMO4Q6EEV6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SUMO4Q6EEV6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUMO4Q6EEV6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms