Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCARA3Q6AZY7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCARA3Q6AZY7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCARA3Q6AZY7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCARA3Q6AZY7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCARA3Q6AZY7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCARA3Q6AZY7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCARA3Q6AZY7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCARA3Q6AZY7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms