Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
C9orf84Q5VXU9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
C9orf84Q5VXU9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.06■■■■■ 4.48
C9orf84Q5VXU9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
C9orf84Q5VXU9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
C9orf84Q5VXU9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
C9orf84Q5VXU9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
C9orf84Q5VXU9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
C9orf84Q5VXU9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
C9orf84Q5VXU9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
C9orf84Q5VXU9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
C9orf84Q5VXU9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
C9orf84Q5VXU9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
C9orf84Q5VXU9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
C9orf84Q5VXU9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
C9orf84Q5VXU9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
C9orf84Q5VXU9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
C9orf84Q5VXU9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
C9orf84Q5VXU9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
C9orf84Q5VXU9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
C9orf84Q5VXU9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
C9orf84Q5VXU9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
C9orf84Q5VXU9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
C9orf84Q5VXU9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
C9orf84Q5VXU9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
C9orf84Q5VXU9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
C9orf84Q5VXU9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
C9orf84Q5VXU9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
C9orf84Q5VXU9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
C9orf84Q5VXU9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
C9orf84Q5VXU9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
C9orf84Q5VXU9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
C9orf84Q5VXU9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
C9orf84Q5VXU9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
C9orf84Q5VXU9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
C9orf84Q5VXU9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
C9orf84Q5VXU9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
C9orf84Q5VXU9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
C9orf84Q5VXU9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
C9orf84Q5VXU9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
C9orf84Q5VXU9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
C9orf84Q5VXU9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
C9orf84Q5VXU9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
C9orf84Q5VXU9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
C9orf84Q5VXU9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
C9orf84Q5VXU9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
C9orf84Q5VXU9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
C9orf84Q5VXU9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
C9orf84Q5VXU9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
C9orf84Q5VXU9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
C9orf84Q5VXU9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
C9orf84Q5VXU9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
C9orf84Q5VXU9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
C9orf84Q5VXU9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
C9orf84Q5VXU9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
C9orf84Q5VXU9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
C9orf84Q5VXU9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
C9orf84Q5VXU9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
C9orf84Q5VXU9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
C9orf84Q5VXU9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
C9orf84Q5VXU9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
C9orf84Q5VXU9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
C9orf84Q5VXU9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
C9orf84Q5VXU9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
C9orf84Q5VXU9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
C9orf84Q5VXU9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
C9orf84Q5VXU9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
C9orf84Q5VXU9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
C9orf84Q5VXU9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
C9orf84Q5VXU9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
C9orf84Q5VXU9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
C9orf84Q5VXU9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
C9orf84Q5VXU9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
C9orf84Q5VXU9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
C9orf84Q5VXU9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
C9orf84Q5VXU9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
C9orf84Q5VXU9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
C9orf84Q5VXU9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
C9orf84Q5VXU9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
C9orf84Q5VXU9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
C9orf84Q5VXU9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
C9orf84Q5VXU9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
C9orf84Q5VXU9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.18■■■■■ 4.34
C9orf84Q5VXU9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
C9orf84Q5VXU9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
C9orf84Q5VXU9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
C9orf84Q5VXU9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
C9orf84Q5VXU9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
C9orf84Q5VXU9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
C9orf84Q5VXU9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
C9orf84Q5VXU9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
C9orf84Q5VXU9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
C9orf84Q5VXU9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
C9orf84Q5VXU9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
C9orf84Q5VXU9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
C9orf84Q5VXU9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
C9orf84Q5VXU9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
C9orf84Q5VXU9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
C9orf84Q5VXU9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
C9orf84Q5VXU9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms