Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD13Q5VXD3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD13Q5VXD3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD13Q5VXD3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD13Q5VXD3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD13Q5VXD3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD13Q5VXD3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD13Q5VXD3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD13Q5VXD3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD13Q5VXD3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD13Q5VXD3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD13Q5VXD3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD13Q5VXD3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SAMD13Q5VXD3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD13Q5VXD3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMD13Q5VXD3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD13Q5VXD3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD13Q5VXD3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD13Q5VXD3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD13Q5VXD3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD13Q5VXD3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD13Q5VXD3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD13Q5VXD3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD13Q5VXD3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD13Q5VXD3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD13Q5VXD3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms