Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFI1BQ5VTD9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GFI1BQ5VTD9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFI1BQ5VTD9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFI1BQ5VTD9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFI1BQ5VTD9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFI1BQ5VTD9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFI1BQ5VTD9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GFI1BQ5VTD9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GFI1BQ5VTD9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GFI1BQ5VTD9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GFI1BQ5VTD9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GFI1BQ5VTD9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFI1BQ5VTD9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFI1BQ5VTD9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFI1BQ5VTD9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFI1BQ5VTD9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFI1BQ5VTD9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFI1BQ5VTD9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFI1BQ5VTD9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GFI1BQ5VTD9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFI1BQ5VTD9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFI1BQ5VTD9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFI1BQ5VTD9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFI1BQ5VTD9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFI1BQ5VTD9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFI1BQ5VTD9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFI1BQ5VTD9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFI1BQ5VTD9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFI1BQ5VTD9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GFI1BQ5VTD9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GFI1BQ5VTD9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFI1BQ5VTD9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFI1BQ5VTD9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFI1BQ5VTD9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GFI1BQ5VTD9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFI1BQ5VTD9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GFI1BQ5VTD9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFI1BQ5VTD9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFI1BQ5VTD9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFI1BQ5VTD9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GFI1BQ5VTD9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GFI1BQ5VTD9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GFI1BQ5VTD9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GFI1BQ5VTD9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GFI1BQ5VTD9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GFI1BQ5VTD9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GFI1BQ5VTD9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GFI1BQ5VTD9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GFI1BQ5VTD9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFI1BQ5VTD9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GFI1BQ5VTD9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GFI1BQ5VTD9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GFI1BQ5VTD9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GFI1BQ5VTD9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GFI1BQ5VTD9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GFI1BQ5VTD9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GFI1BQ5VTD9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms